Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms