Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNRF4Q8WWF5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms