Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms