Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms