Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms