Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDKL3Q8IVW4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms