Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME9Q86XW9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms