Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GDPD3Q7L5L3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms