Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms