Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF8Q5VWM4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF8Q5VWM4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms