Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf17Q53FE4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms