Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC25A52Q3SY17 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms