Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00303Q3SY05 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms