Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms