Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL40Q2TBA0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms