Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT24Q2M2I5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms