Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RRN3P1Q2M238 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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RRN3P1Q2M238 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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RRN3P1Q2M238 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RRN3P1Q2M238 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RRN3P1Q2M238 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RRN3P1Q2M238 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RRN3P1Q2M238 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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