Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KNOP1Q1ED39 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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