Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
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RTL8BQ17RB0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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RTL8BQ17RB0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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RTL8BQ17RB0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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RTL8BQ17RB0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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RTL8BQ17RB0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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RTL8BQ17RB0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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RTL8BQ17RB0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RTL8BQ17RB0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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