Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IMPG1Q17R60 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms