Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DDR2Q16832 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DDR2Q16832 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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