Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CRY1Q16526 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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CRY1Q16526 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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CRY1Q16526 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CRY1Q16526 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CRY1Q16526 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CRY1Q16526 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CRY1Q16526 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CRY1Q16526 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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CRY1Q16526 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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CRY1Q16526 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRY1Q16526 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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