Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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