Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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