Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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