Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CYTH1Q15438 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYTH1Q15438 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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