Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PUM3Q15397 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PUM3Q15397 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PUM3Q15397 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PUM3Q15397 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PUM3Q15397 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PUM3Q15397 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
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