Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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UBE3CQ15386 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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UBE3CQ15386 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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UBE3CQ15386 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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UBE3CQ15386 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBE3CQ15386 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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