Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPRKQ15262 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
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