Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GAPVD1Q14C86 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
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