Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SHROOM2Q13796 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
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SHROOM2Q13796 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
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SHROOM2Q13796 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
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