Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNASE1L3Q13609 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms