Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF6Q13247 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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