Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF5Q13243 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF5Q13243 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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