Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMD2Q13200 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms