Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CHAF1BQ13112 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHAF1BQ13112 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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