Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms