Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 13e-7■□□□□ 10
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ILF3Q12906 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.082e-6■□□□□ 9.9
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ILF3Q12906 TCF7L2-205ENST00000355717 1979 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.995e-7■□□□□ 9.9
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ILF3Q12906 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.335e-7■□□□□ 9.9
ILF3Q12906 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.45e-7■□□□□ 9.9
ILF3Q12906 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.45e-7■□□□□ 9.9
ILF3Q12906 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.465e-7■□□□□ 9.9
ILF3Q12906 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.485e-7■□□□□ 9.9
ILF3Q12906 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.485e-7■□□□□ 9.9
ILF3Q12906 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.525e-7■□□□□ 9.9
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ILF3Q12906 ZNF160-210ENST00000599637 565 ntTSL 415.85■□□□□ 0.135e-8■□□□□ 9.9
ILF3Q12906 ZNF160-201ENST00000355147 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.95e-8■□□□□ 9.9
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ILF3Q12906 ZNF160-209ENST00000599247 1926 ntTSL 1 (best)6.97□□□□□ -1.295e-8■□□□□ 9.9
ILF3Q12906 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.315e-8■□□□□ 9.9
ILF3Q12906 ZNF160-215ENST00000601982 668 ntTSL 36.88□□□□□ -1.315e-8■□□□□ 9.9
ILF3Q12906 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.515e-8■□□□□ 9.9
ILF3Q12906 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.551e-323■□□□□ 9.9
ILF3Q12906 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.254e-7■□□□□ 9.9
ILF3Q12906 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.814e-7■□□□□ 9.9
ILF3Q12906 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.774e-7■□□□□ 9.9
ILF3Q12906 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.024e-7■□□□□ 9.9
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