Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFFO1Q0D2I5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms