Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLFN5Q08AF3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms