Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC3A1Q07837 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms