Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLE4Q04727 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms