Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms