Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF2BQ00403 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF2BQ00403 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms