Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
VLDLRP98155 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VLDLRP98155 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms