Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB1P82279 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB1P82279 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB1P82279 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB1P82279 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms