Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms