Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
RPS29P62273 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
RPS29P62273 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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