Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VBP1P61758 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VBP1P61758 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms