Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2FP61218 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2FP61218 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms